Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms