Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms