Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms