Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms