Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms