Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms