Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NESP48681 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NESP48681 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NESP48681 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NESP48681 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NESP48681 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NESP48681 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NESP48681 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NESP48681 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms