Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLCP48506 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLCP48506 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLCP48506 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLCP48506 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLCP48506 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms