Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms