Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms