Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL9P32969 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL9P32969 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms