Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO2P25791 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms