Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRCP23327 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HRCP23327 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRCP23327 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms