Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR4P22455 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms