Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms