Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms