Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SURF6O75683 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SURF6O75683 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SURF6O75683 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms