Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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