Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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