Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMAD6O43541 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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