Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNRC18O15417 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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