Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms