Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TISP43B9A030 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms