Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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