Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms