Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms