Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms