Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms