Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00474Q9P2X8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms