Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMC3IPQ9P2W1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMC3IPQ9P2W1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms