Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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