Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms