Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms