Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms