Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms