Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRP1Q9C000 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms