Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms