Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SEMA3CQ99985 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SEMA3CQ99985 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SEMA3CQ99985 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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