Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms