Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms