Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms