Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms