Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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