Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms