Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms