Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM35BQ8NCS4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms