Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTOAQ7RTW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms