Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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