Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms