Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms